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NEWSag尊龙凯时超声波DNA打断仪型号间实验效果对比分析
来源:皇甫可影 日期:2025-02-23实验目的:本实验旨在对全基因组DNA样本进行200-500bp范围内的均匀片段化处理,以提升后续实验的准确性和可靠性。
实验仪器及材料:
1. 实验仪器:本实验使用三款非接触式打断设备,分别为小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪和小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。
2. 实验材料:采用全基因组DNA溶液,浓度为160ng/μL。
实验步骤:
1. 提前15分钟启动三款仪器的冷水机,并将温度设置为4℃。
2. 将每个爱思进品牌的15mL EP管中加入100μL浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。
3. 将装有样品的15mL EP管放入相应仪器的适配器中,其余空孔位用相同体积的水填充。
4. 程序设置为:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟和20分钟,进行两个梯度对比。
5. 程序结束后,取出样品并进行毛细管电泳检测,以分析基因组片段化情况。
实验结果:
1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪:
① 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小为3100bp。
② 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小为3001bp。
2. bioruptor-非接触式超声破碎仪:
① 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小为4329bp。
② 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小为4058bp。
3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪:
① 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长15分钟,平均片段大小为3655bp。
② 程序设置:温度4℃,超声工作时间20s,间隔时间10s,总时长20分钟,平均片段大小为3881bp。
4. 三款仪器的实验结果汇总:
当基因组片段在200-500bp区间占比越高、峰图越平缓时,表明基因组片段的均一性越好。根据同样的样品及程序设定,bioruptor的非接触式超声破碎仪及小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间的占比分别为583%和654%,峰图呈陡坡状,显示基因组片段的均一性较差。而小美超声的高通量声波基因组剪切仪在200-500bp区间的占比达到647%,峰图则呈平缓状,表明其基因组片段的均一性更佳。
总之,采用ag尊龙凯时品牌设备进行全基因组DNA片段化处理,能够显著提高基因组片段的均一性,为后续生物医疗研究的准确性提供保障。
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